Северная война во взаимоотношениях России и Украины
Новый перелом во взаимоотношениях России и Украины обозначился в ходе Северной войны (1700—1721). Все более отчетливо обнаруживалось стремление государственной власти к унификации прав и политической и социальной ситуации. Особенно опасным для Гетманщины стало возвышение А. Д. Меншикова, который стремился захватить собственность на богатых украинских землях и устранить власть гетманского уряда. Ситуацию нагнетали также поражения России и военные тяготы, противоречивые и часто отменяемые указания Петра I.
В 1700 г. по приказу царя 12-тысячный корпус под командованием племянника И. Мазепы (и предполагаемого наследника) наказного гетмана Ивана Обидовского двинулся в Прибалтику. После поражения россиян под Нарвой именно украинские войска, расположенные в Печоре, отбили продвижение шведских войск на Псков. В декабре 1700 г. на выручку И. Обидовскому пришел сам И. Мазепа с 18-тысячным корпусом. Однако из-за суровых условий местности, непогоды начались голод и болезни, от которых погибли тысячи казаков. Запорожцы постоянно дезертировали и грабили местное население. Большим несчастьем для гетмана стала смерть от болезни племянника. Все это вынудило И. Мазепу увести казаков в Украину. Весной 1701 г. он получил приказ помогать Августу II на территории Беларуси и Волыни, а пять полков во главе с миргородским полковником Д. Апостолом были направлены в Прибалтику, где участвовали в разгроме шведов под Эрестфером (Лифляндия) в декабре 1701 г.
Военные тяготы и гибель казаков вызвали широкое недовольство в Украине, что уже в конце 1701 г. выразилось в ряде локальных выступлений против гетмана. В январе 1702 г. массовым явлением в полках Д. Апостола стало бегство казаков к шведам. Была очевидной устарелость казацких полков в противостоянии с регулярной и профессиональной шведской армией «нового строя». Только компанейские (из наемников) и сердюцкие (личная гетманская гвардия; пехотинцы) полки проявили себя на первом этапе Северной войны как самые боеспособные силы. Это и мотивировало царя к преобразованию в сентябре 1705 г. Прилукского и Киевского полков в драгунские. Тем самым ущемлялись полномочия гетмана, а также проявились планы царя по упразднению автономной административно-полковой системы Украины.
Между тем в феврале 1703 г. Польша, раздираемая гражданской войной, обратилась к союзнику Петру I за помощью в подавлении восстания С. Палия на Правобережье. Царь и И. Мазепа на переговорах в Москве в сентябре 1703 г. приняли решение содействовать восстановлению единства Украины под гетманством И. Мазепы и не уступать территорий полякам с тем, чтобы предупредить связи Швеции и сторонников С. Лещинского с Турцией. Уже тогда ни Россия, ни Гетманщина с территориальной целостностью дряхлой Речи Посполитой не считались.
В июне 1704 г. армия И. Мазепы выступила на правый берег Днепра и в течение месяца заняла все Правобережье. В конце июля 1704 г. он устранил С. Палия и стал полновластным «гетманом обоих берегов». Белая Церковь была укреплена и стала гетманской резиденцией в крае. Характерно, что сам Петр I всячески способствовал в 1704—1707 гг. укреплению власти И. Мазепы на Правобережье, и тот прочно владел регионом. Содействовало гетману и то, что в Речи Посполитой шла гражданская война между сторонниками Швеции (короля С. Лещинского) и Саксонии и России (короля Августа II). Армия Гетманщины вела боевые действия против домовых армий Потоцких и Сапег (личные военные подразделения магнатов из зависимой шляхты, обязанных военной службой крестьян и наемников), занимала и разоряла их владения. Крупным достижением в ноябре 1705 г. стала капитуляция перед гетманскими войсками мощной крепости Замостье. Но Петр I, стремясь сохранить союз с поляками, на переговорах в декабре 1705 г. в Гродно с канцлером Великого Княжества Литовского К. С. Радзивиллом и маршалом коронным и Сандомирской конфедерации С. Денгофом тайно обещал уступить Правобережье Польше — «к крайнему малороссийскому убытку», по собственному признанию царя.
В апреле 1707 г. на военном совете в Жолкве последовали царские указы о подчинении Киева с малороссийскими городами общероссийскому Разрядному приказу, а также о наборе 1/5 всех казаков для составления компанейской армии «нового строя» и уступке полякам Правобережья. Кроме того, Петр I, паникуя перед наступающими шведами, активно реализовывал стратегию «выжженой земли» от Пскова до Киева (и в России, и в Европе было распространено мнение об успехах шведов в противостоянии с россиянами). Все это обострило антироссийские настроения в Украине, и старшина открыто стала призывать гетмана к «отложению» от России. Прибавились также неудачи в войне со шведами на белорусских территориях: в марте 1706 г. шведы внезапно захватили Несвиж и вырезали гарнизон во главе со стародубским полковником М. Миклашевским, а в апреле 1706 г. был пленен гарнизон Ляховичей во главе с переяславским полковником И. Мировичем.
В октябре 1706 г. польский король Август II был разбит и подписал со Швецией сепаратный договор в Альтранштаде, по которому он отказывался от короны в пользу С. Лещинского и разрывал союз с Россией. После этого украинская старшина стала искать опоры во внешних силах. Ряд полковников, происходивших с Правобережья, во главе с генеральным обозным И. Ломиковским ориентировался на союз с Польшей. Старшина Полтавского полка во главе c генеральным судьей В. Кочубеем и полтавским полковником И. Искрой склонялись к союзу с Крымом и Турцией. Гетман И. Мазепа не был готов к разрыву с Россией. В 1705 г. он вел через княгиню Дольскую переписку с С. Лещинским, однако подробно информировал о ней Петра I. Выяснилось, что компромисса с Речью Посполитой быть не могло, так как король не собирался уступать Правобережье. Поэтому, предупреждая вторжение армии С. Потоцкого, в апреле 1708 г. гетман с крупным загоном разместился в Белой Церкви.
Вместе с тем с 1706 г. при посредничестве С. Лещинского И. Мазепа вел тайные переговоры с Карлом XII о переходе Гетманщины под шведский протекторат. В сентябре 1706 г. гетман предложил шведскому королю план боевых действий: для разгрома российской армии Карл XII должен был вести наступление через Волынь на Гетманщину и оттуда, усилив армию казацкими войсками, идти на Москву. Однако в 1707 г. король повел наступление через белорусские земли на Смоленск и не воспользовался взрывом антирусских настроений в Украине. И. Мазепа занимал выжидательную позицию и проявлял лояльность по отношению к Петру I, помогал в разгроме восстания Кондратия Булавина на Дону.